2031年,由于作为次世代能量装置而开发的“量子反应堆”的暴走事故,世界剧变。突然从地下蔓延的闪光,吞噬都市楼群、覆盖大地,最终,超越、融合了生物、机械、植物的未知特异进化生物“B.R.A.I”出现了。 7年后,翔龙重生为绝对防卫都市“新翔龙”。它以惊人的速度完成进化,并成为与陷人类于灭亡危机的B.R.A.I相对抗的人类最后的希望要塞。 被命运所引导而集合在新翔龙的雷昂、可依、坤灵、道格。将他们迎入防卫军的塞西尔、凯恩、杰、格伦。于是,赌上人类存亡而战的特殊部队“潘多拉”诞生了。 契约之时,希望被托付给了他们——。韩国反恐局最优秀特工李正宇偶遇情报局展厅向导尹惠仁,被其深深吸引,无奈屡屡示好均被冰山美人果断拒绝,不解之余渐渐感觉到惠仁身上似乎有别样身世迫其努力与他人保持距离。
时值韩国自主研发最新核反应堆关键时刻,而这一消息对名为“雅典娜”的组织而言则如惊天霹雳,此秘密存在的组织一直掌控着全球能源市场,为保住其统治地位,不惜发动恐怖袭击甚至挑起战争。此次韩国成了他们的眼中钉,为达目的,组织动用了其核心成员,安插在美国情报局东亚分部的部长孙赫利用职务之便,不惜一切阻止韩国的研发进程,必要再掀一番血雨腥风。。