随着Peter进入末日机器并将两个世界融合在一起,表面的危机似乎解除,但是Peter却被时间线所抹杀。两个世界的人一边要消除与对方之间的隔阂,一边针对两个世界之间不减反增的潜科学案件,神秘莫测的观察者神出鬼没也给众人留下众多疑问,又是什么在黑暗中操控着这一切呢?。主人公岛村乔,某日被神秘的男人们抓住改造成了人造人。在世界的暗影中活跃着的死亡商人“黑幽灵团(Black Ghost)”为了制作划时代的新商品•人造人士兵的试验品,偶然地选择了乔。但是,乔被先前改造的8名人造人和改造他们的吉尔莫亚博士告知了当下的情况后,与他们共同从黑幽灵团逃走了。 他们在得知黑幽灵团的野心后便不断阻止敌方的行动,然而拥有着同样力量的人造人战士却只有他们。胸中怀着人类的心和机器所没有的悲伤心情,人造人战士们为了粉碎黑幽灵团的野心而不断地持续着战斗。。