一款名为Wisher的APP毫无征兆的出现在一群大学生的手机里,只要向它许下愿望,完成随机分配的简单任务,愿望便能实现。一群经受不住诱惑的年轻人,深陷其中,前赴后继的组成了欲望控制下的多米诺骨牌。这一切的背后,都被一个神秘组织操控着.....。在被德国占领的波兰,年轻一代长大了。Stach就是其中一个,他和朋友们起初只是自发地从事危险的抵抗活动,总的来说是无组织无目的。后来在一个慈祥的共产党干部的带领下,他接触到了地下组织。当看到那个勇敢美丽的青年领袖Dorota时,他就加入了进去并与Dorota坠入爱河。接着Stach就投入反抗压迫和屈辱的危险活动中,直到要对其他人的生命负责时他就变成熟了。不幸的是Dorota被逮捕,Stach悲痛欲绝。与此同时,地下抵抗组织招募了新成员,新的一代正在成长。。1971年时,邪恶的修卡组织命令科学家百濑龙之介做实验,将人类改造成怪物。龙之介不愿再助纣为虐,于是修卡组织利用龙之介释放出恶魔迪亚波罗后,将其流放至宇宙,龙之介意外通过黑洞穿梭至2071年的未来世界,发现那时世界已经由恶魔迪亚波罗掌控,为了拯救世界,他使用回旋加速驱动器来到了2021年,打算与自己的儿子秀夫合作,对抗迪亚波罗。但秀夫不愿原谅抛妻弃子的父亲,局面陷入了僵持。五十岚一辉、神山飞羽真、狩崎还有各位假面骑士,纷纷挺身而出对抗邪恶势力。秀夫最终也被亲情感化,原谅了父亲龙之介,父子俩成功变身为假面骑士世纪。各位骑士穿梭于未来与现在,为了守护世界而战,迪亚波罗最终被消灭,龙之介与秀夫间也不再有隔阂。。