高中生阿武和F1偷电动车,卖给一帮不良少年兼职赚钱。一天,转学到阿武学校的绫香加入了他们,三人决定一起偷电动车。 当他们像往常一样试图偷一辆停在荒废公寓里的轻便电动车时,却被一个蒙面女人发现,她似乎就是车主。 阿武和他的朋友们急忙骑着摩托车逃跑,但他们很快就被一个女人追上了,这个女人的奔跑能力让人觉得她几乎没有人性。 这个戴面具的女人就是传说中能在6秒内跑完100米的"裂口女"!他们的命运将会如何? 裂口女的真实身份又是谁?。小智(松本梨花 配音)带着皮卡丘(大谷育江 配音),和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上,一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴(钉宫理惠 配音)的少女麦亚丽(中川翔子 配音)。胡巴能够制造出神奇的时空圆环,带领大家在不同的地点来回穿梭。
地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了,曾经,在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争,亦是因为这场战争,这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里,麦亚丽和哥哥巴尔扎(藤原龙也 配音)汇合了,让大家没有想到的是,巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中,封印被解开了,那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日,而它的真实身份,竟然是超胡巴(山寺宏一 配音)。。