故事讲述了核武专家斯蒂尔决定向世人公布埋藏在他内心已久的秘密时,却突然被劫持谋杀,随身携带的装有绝密资料的手提箱随之丢失,举世为之震惊。不久,在中国领海外,出现了一艘神秘舰船,一群不明身份的外籍人士,准备打捞冷战时期某大国遗留在深海海底的核弹并实施恐怖袭击。恐怖分子的目标并非某个大都市,而是意欲在活跃的环太平洋地震带引爆核弹,引起超级地震及巨大海啸,沿海数十个国家将遭遇灭顶之灾。千钧一发之际,在中国国家反恐中心和军方全力配合下,一对欢喜冤家携手,成功挫败恐怖分子阴谋,挽救了上千万人的生命,夫妻情感也得以升华……。大内库藏武功秘笈《葵花宝典》失窃。东厂主管太监古今福(刘洵 饰)率千户欧阳全(张学友 饰)等,南下调查辞官锦衣卫林镇南,同时收用“五岳盟主”左冷禅(元华 饰)外围策应。华山派大弟子令狐冲(许冠杰 饰)与师妹岳灵珊(叶童 饰)奉师命增援林镇南,无奈两人实力不济,领得林镇南遗嘱后遁走,二人于路先后巧遇顺风堂堂主刘正风(午马 饰)、日月神教长老曲洋(林正英 饰)、华山派风清扬,获传《笑傲江湖》曲谱和独孤九剑。
各路人马为《葵花宝典》纷纷聚于苗人地界,欧阳全与左冷禅争功不下,遂假扮林平之混入华山派一行。令狐冲结识日月神教任盈盈(张敏 饰)与蓝凤凰(袁洁莹 饰),因曲洋之关系得其协助。古今福与岳不群为《葵花宝典》大打出手,令狐冲不忍一班师兄弟受牵连愤而使出独孤九剑,始明了“笑傲江湖”真意。
本片根据金庸同名小说改编。。