逃学小魔仙小千为寻找母亲而逃到人类世界,小蓝奉命追寻,在人类世界再遇美琪、美雪。与此同时,环绕着魔仙堡的彩虹能量忽然消失了,因为魔仙堡受到了邪恶的巫神天龙袭击,破坏了魔仙堡能量之源--彩虹之花。发出七色光芒的彩虹之花本是维系着整个魔仙堡的巨大能量来源,如今变得暗淡无色,逐渐枯萎,魔仙堡也因而失去能量,逐渐下沉至湖底,危在旦夕;魔仙女王利用法力暂时保护着魔仙堡,正在束手无策之际,小蓝、美琪、美雪、小千得知魔仙堡中有一本「彩虹笔记」,记载了有关彩虹之花的历史,并得千年花精灵诗诗的帮助,找到挽救魔仙堡的方法。原来要修复彩虹之花,要先为七枚「彩虹心石」收集能量,七枚心石分别代表七种正能量:勇气、正义、怜悯、寛恕、关爱、无私,女王指派小蓝、小千、美琪、美雪、游乐、青青离开魔仙堡收集宇宙正能量以修复彩虹之花,但巫神指派使者不断阻挠各人收集能量。小千之母魔仙若琳当年逃离魔仙堡后,被巫神所利用,迷失了本性,成为巫神使者水灵,并使出一切手段对付各人,展开一段正邪之战。各人尽力为彩虹心石收集能量,六枚彩虹心石先后成功充满能量,唯独其中一枚,毫无进展,几乎令各人功亏一篑,几经转折,当魔仙若琳发现女儿就是小千,甘愿为小千牺牲,便为最后一枚代表「无私」的心石收集了足够的能量,「彩虹之花」亦因而复苏,拯救了魔仙堡,解除了一场危机。。由于父亲欠下了一屁股债人间蒸发,无家可归的女儿桃园奈奈生(三森铃子 配音)只得流浪街头。在这途中,奈奈生帮助了一位被恶狗追逐的男子,男子告诉奈奈生自己名叫御影(石田彰 配音),而在得知了奈奈生的遭遇后,他意外的提出将自己的住处让给奈奈生。一间荒芜的神社——这便是御影所说 的住处,奈奈生自觉上当,却也没有别的地方好去。更令她吃惊的是,御影竟然是神社的土地神,而如今,土地神的头衔,自然也随着住处转嫁到了奈奈生的头上。
莫名其妙的成为了土地神,而身边又出现了称她为“主人”的神使巴卫(立花慎之介 配音),奈奈生还未搞清楚状况,各路个性可爱又调皮的神灵就接二连三的降临到了她的身边。。