10岁的女孩查莉(布丽特妮·罗伯森 Brittany Robertson 饰)和身患重病的母亲过着相依为命的日子。一天,一位名为丘奇(艾迪·墨菲 Eddie Murphy 饰)的男人敲响了查莉家的大门,他是来这里照顾这对可怜的母女两的,他的任期很短,只有6个月。然而,丘奇先生在查莉家一待就是六年之久,在他的教导之下,本来毫无目标的查莉开始想要成为一名作家。 母亲去世之后,查莉渐渐和丘奇先生失去了联系,走上了自己的人生道路。在上大学的第二年,查莉发现自己的怀孕了,六神无主的查莉再度想到了丘奇先生,并且敲响了他家的家门。丘奇先生收留了查莉,并且担负起了照顾查莉母女两人的责任。。都内で、遺体に「X」の痕跡を遺す殺人事件が発生する。事件を担当するはずだった刑事・安堂源次(安田顕)は捜査から外された。かつて自身の妻が被害者となった連続殺人と同じ犯人の可能性が高いからだ。そこで捜査本部には内密に、天才科学者と云われる神保仁(田中圭)に捜査の協力を要請する。事件の解決に全く興味を示さない神保。何よりその奇想天外な行動と言動に源次は振り回される。しかし徐々に息の合い始める二人。そして二人の孤独なDNA捜査は、捜査本部も気づかなかった「ある痕跡」を見出す。そんな中、「殺人鬼X」による更なる殺人が起きてしまう…。。