故事发生在布鲁克林恶名昭彰的布朗斯维尔区,埃迪·杜根(理查·基尔 Richard Gere 饰)是一位还有一个星期便可退休的老警察,二十多年的职业生涯让他看透了肮脏的社会规则,只求顺利退休,别节外生枝。然而事与愿违,他被分配负责监督一名新丁上岗,似乎每个初当警察的小伙子都有着拯救世界的固执,这令埃迪乏力厌恶。萨里(伊桑·霍克 Ethan Hawke 饰)是一名领着普通薪水的纽约警察,拥有好几个孩子的他却仍然与妻子住在狭窄的黑人区,受尽奚落,为了筹钱买房,他开始打起警局缴获赃款的主意。而谭戈(唐·钱德尔 Don Cheadle 饰)则是警方派到毒贩集团的卧底,在完成最后一个任务后便可得到他梦寐以求的一份文员工作,然而这次任务的对象却是曾经救过他一命的毒贩卡兹(韦斯利·斯奈普斯 Wesley Snipes 饰),谭戈陷入两难抉择。意想不到的是,命运却将这三个无助的人引向了同一点……。来自异次元的种族MU占领了东京,并将城市隐藏在巨大的防护壁之后,他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外,名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日,在同MU激烈交火之时,一位名为神名绫人(下野紘 配音)的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中,在这里,绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”,并且成为了它的驾驶者。
在神秘女子的紫东遥(久川绫 配音)的带领下,绫人来到了防护壁之外,加入了TERRA,并且在那里遇见了名为如月久远(桑岛法子 配音)的女子。MU组织对TERRA发起了进攻,当TERRA的存亡陷入危机之中时,绫人再一次驾驶着Rahxephon,成为了这个组织的救世主。。