影片背景设置在11世纪的波斯,一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身份,加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他的老师名叫阿维森纳,是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种,最著名的有《哲学、科学大全》,在当时是高水平的百科全书;另一部 巨著是《医典》,直到17世纪西方国家还视为医学经典,至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构,展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。。万森斯一家(工作狂克里斯蒂安,他的妻子比莉和两个孩子兰加和蒂莫)和大多数家庭一样过着平凡人的生活。四年后,终于迎来休假的一家人决定坐游船游览加勒比海,尽管弗林船长和他那年久失修的破船离他们想象的相去甚远。万森斯一家并不知道,等待他们的将是一次令他们毕生难忘的旅行……一伙海盗强行霸占了船,万森斯一家不得不乘救生筏在海上漂流。最终,他们来到了一个荒凉的,长满棕榈树的小岛。虽然暂时逃出了死神的魔爪,但他们的前景并不乐观。没有住所,没有食物,他们必须想办法在这艰苦的条件下存活下去。这时,从海盗手中逃出的弗林船长也来到了小岛。原本对他怀有戒心的克里斯蒂安渐渐意识到,只有团结才能助他们逃离这个孤岛……。