在未来的大都会里社会分为两个阶层。建立并策划了整个城市赖以运转的庞大机器的是以强·弗莱德森为首的资本家,他们生活在富丽堂皇的摩天大厦之内;靠劳动以双手建立了机器并日夜维护的则是广大的工人团体,他们群居于黑暗的地下城。有一天,在弗莱德森为子女修建的美丽花园中,他的儿子弗雷德对工人之女玛丽娅一见钟情,追随她进入了地下工厂城,亲历机器事故。被悲惨景象惊呆的弗雷德决定追随玛丽娅;与此同时,对工人传单不解的弗莱德森则求助于过去的科学家对头洛特汪。洛特汪建造出一个以玛丽娅面目出现的机器人,试图煽动工人暴乱,彻底摧毁弗莱德森的机器世界。一年一度的七夕即将到来,东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案。被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于案发范围过大,各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情,名侦探毛利小五郎也被邀请参加,江户川柯南则偷偷听取了会议的内容。会后,江户川柯南无意中听到群马县的山村操警官哼唱的童谣,继而发现有黑暗组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中,柯南遇到假扮人质的苦艾酒,得知近期一连串的杀人案件与存有组织内部人员资料的记忆卡有关。与此同时,潜入警察内部的间谍偷偷盗取工藤新一和柯南的指纹,新一的身份眼看就要被拆穿了,巨大的危险正向柯南和他身边的人急速袭来!意识到事情危险性的江户川柯南独自展开了调查……。