故事发生在一座名叫玻璃浦的海滨小镇上,帝都大学物理学副教授汤川学因公来到此处,入驻了名为“绿岩庄”的旅馆。在旅馆里,汤川结识了名叫恭平的男孩,奇怪的是,平常一接近小孩子就会浑身起疹子的汤川这次竟然安然无恙,这让敏锐的汤川对恭平产生了兴趣。
冢原正次的尸体被发现于岸边的碎石场上,他生前亦是绿岩庄的客人,为了寻找一名叫仙波英俊的杀人犯而来到玻璃浦。尽管冢原的死充满了疑点,但警方依旧判断,这只是一起意外坠落事件。为了调查事件的真相,岸谷美砂随同僚们赶到了玻璃浦,让美砂感到奇怪的是,一向对案件避之而不及的汤川竟然主动请缨要求协助调查此事。。一段“文比围棋,武比刀枪”的传说在棋坛和武林间同时徐徐拉开了帷幕,正邪双方各自为了实现自己的理想而拼尽全力。一场“明比围棋、暗比刀枪”的正邪对抗在以国家强大、百姓安居乐业为奋斗目标的小明皇、江流儿等人和以穷兵黩武、横征暴敛让百姓处于水深火热为目的的幽王、棋鬼王等人的双方阵营中以火星撞地球般的冲击力迸射出耀眼的光芒。。