身为教师的主人公,在儿子就读的学校里发现了一个来自过去的时间囊,时间囊中有一些图画文件之类的东西,上面写着对未来世界的预言。其中有一些现在已经实现,而另一些则有可能将要发生。最可怕的是,它预言地球即将毁灭,主人公被迫在有限的时间内采取行动,以阻止预言的实现。。平凡的一天,出木杉君带来了《乌托邦》这本小说,为同学们讲述理想国的故事。那个没有考试和学校的国度,深深吸引着吊车尾的大雄。偶然机缘,大雄在后山看到了一个新月形状的悬浮物停在空中,随后很快消失。这个发现让他无比兴奋,于是认定这就是传说中的乌托邦。他拜托哆啦A梦寻找历史上的相关报道,随后又买来时空穿梭飞艇,和胖虎、小夫、静香前往新闻中各个时代的目击点寻找新月形悬浮物。但是大多数发现都是自然现象或者人工产物,似乎天空的乌托邦真的就只是一个传说。
直到某天,那个悬浮物再度出现,引领少年们开启一段全新的冒险……。