掌控日本国家未来的御前会议上,众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”,神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后,暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫(户田惠梨香 饰)和濑文焚流(加濑亮 饰)负责。调查途中两人接到志村美玲(福田沙纪 饰)的求救电话,赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子(栗山千明 饰)不期而遇。当麻将美玲带回未详系,原本已经死去的阳太/一十一(神木隆之介 饰)竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手,当麻无力的目睹美玲匆忙留下“一定要阻止法蒂玛第三预言”的信息后被阳太带走。
在阳太的恶意煽动下,普通人类与SPEC持有者间的矛盾日益激化。身处两者夹缝之中,当麻对法蒂玛第三预言和人类未来的走向充满了迷惑。玛利亚、白衣教皇、左手持火之剑的天使……预言中的关键人物们若隐若现,黑暗降临的未来是否终将无法避免?。十八年前,小蝶(徐申东饰)在雷电交加之夜诞生,然而她的降生却引发了全村大火,不仅如此,还导致了她亲生父亲的死亡,仿佛她就是灾祸的象征。天庭得知了小蝶的出生,发现她是八百年一次的灾星托世,这对人间将会带来灾难性的后果,因此决定派遣使者前去终结小蝶的生命。然而,道济(陈浩民饰)得知此事后出面阻止,并在小蝶身上施加了一道封印,保护她免遭他人包括神仙的伤害,认为小蝶的诞生乃是天意,相信十八年后她的灵性将会成长,他有信心可以拯救她。十八年转瞬即逝,道济与其他仙人前往找到了小蝶,然而双方立场不同。其他仙人认为小蝶是灾难的化身,为了苍生安全必须将她消灭,而济则以大爱之力希望能够将她救化成人。双方约定了七日期限,若济不能在七天内完成任务,就将被迫消灭小蝶。济发现小蝶体内寄居着数个元神,这些元神分别是小蝶前几世的不同化身,因为都是含恨而死,所以怨念一直缠绕在她身边...。