1992年,一架飞碟突然出现日本上空。飞碟走下三名自称时来自23世纪地球联邦机构的官员,他们要求直接与日本首脑对话,敦促日本尽快消灭哥斯拉,防止重蹈未来亡国的命运。
专事研究各种神秘事件的寺泽健一郎(丰原功补 饰)在未来写过《哥斯拉诞生》一书,其中披露了这只恐怖怪兽诞生的秘密。根据这本书的记载,未来人提出要健一郎、曾在太平洋战争期间目击哥斯拉的恐龙专家真崎洋典(佐佐木胜彦 饰)以及国家超科学研究中心成员三枝未希(小高惠美 饰)乘坐时光机返回1944年的拉哥斯小岛,试图将哥斯拉传送到别的地方。
寺泽他们的行动取得成功,但是20世纪却出现了另一头怪兽三头金龙王。种种诡异事件的背后,可怕的危机遽然降临……。沙皇的残暴统治让人民们苦不堪言,一群思想先进的贵族青年们决定将他们的力量集结起来,一举推翻沙皇的统治。在十二月,这群有志青年们发起了武装起义,不幸的是,起义失败了,青年们遭到了当局残酷的镇压,领袖人物全部被处以极刑,德鲁别兹卡雅公爵(阿勒克塞·巴塔洛夫 Aleksey Batalov 饰)、伏尔康斯基公爵(奥列格·斯特里仁诺夫 Oleg Strizhenov 饰)等参与者则被流放到了遥远的西伯利亚。 得知丈夫们被流放的消息,德鲁别兹卡雅公爵夫人(伊琳娜·库普琴科 Irina Kupchenko 饰)、伏尔康斯基公爵夫人(纳塔莉亚·邦达尔丘克 Natalya Bondarchuk 饰)等人毅然决然的放弃了优渥的生活,踏上前往西伯利亚的旅途,发誓要和她们的丈夫们同甘共苦。。