巴黎医院中,滤过性病原体学者劳伦斯被一种不知名的病毒感染,即使她的前夫,著名的生物学家也无法解释。不久之后,发现该病毒与老鼠有关,与此同时由于清理垃圾工人的罢工,城市一时间老鼠泛滥。劳伦斯异常的恐惧,而当她的女儿被老鼠咬伤后犯病,她的怀疑得到了确定。一场与时间的竞赛开始了。劳伦斯一方面要抓紧时间研究抵抗病菌的药物,一方面要催促政府立即采取行动。亚力克斯的父亲也是受害者之一,亚力克斯所饲养的宠物小白鼠埃尔顿也被咬伤了,但它并没有传染上病毒。成千上万的老鼠涌入城市,劳伦斯发现他们所饲养的两只老鼠已经基因变异,感染了病毒,并跑了出去。而负责这项实验的负责人正是劳伦斯的前夫…。三只小猪因顽皮遇险,被功夫侠阿潘和阿达所救,因此小猪们死缠烂打跟着两位学功夫。可是,当小猪们发现两位大侠并不像自己想象中那般厉害,便决心靠自己的力量打败功夫怪狼,却因为冲动莽撞再次引来了更大的灾难。功夫怪狼以三只小猪为要挟,逼阿潘与阿达再次出手,能力与责任、正义与力量,一场森林王国的巅峰对决就此展开。。