本作围绕着高中生的日常生活,讲述了在“炼金术”盛行的时代中,青年人们为了守护正义、追逐梦想,而勇敢对抗邪恶势力的故事。
炼金术本来指的是尝试从普通金属中提炼黄金的技术,随着科技发展,炼金术士们尝试将人类的肉体和精神作为对象,加以熔炼。汇集这种炼金术的精华而创造出来的,就是完全的人工生命体,101只“凯米”。
可是原本应该被封印在“凯米卡”里的凯米突然被释放了,探求梦想的高中生一之濑宝太郎偶然目击了这一过程,从此被卷入了这场风波中。他与凯米相遇,结识神秘的女同学九堂凛音,还被托付了变身腰带。
一之濑宝太郎决心保护凯米不被邪恶势力利用,并立志要与凯米成为同伴。于是他和朋友们一起变身为假面骑士,开始了追逐梦想的旅途,一群青涩懵懂的高中生也逐渐成长。。传说,日本战国时代有一种隐秘的变身法术。国家太平后这本被封禁的法术书卷存于桐生宗族,宗族中一个叫做久世肯赞的忍者偷走书卷,那人偷走书卷后便人间蒸发。多年之后,久世肯赞去世,随后他的儿子东立巧遇了一只猫,通过猫的种种行为便认定了他是自己的父亲久世肯赞。逃走的忍者必须接受死亡的惩罚,桐生宗族的领袖桂木大师下令缉拿他们父子一人,东立长大后与这只叫“父亲”的猫亡命天涯,遇到追兵无数与危险擦肩而过是家常便饭,被人称作猫忍。父亲失踪谜团重重,幼年的同伴燕也无奈成为追兵中的一员,东立进退两难。担忧如影随形,但他与这只叫做“父亲”的猫在一起,无论如何都是幸福的。最终,这只猫教会了东立如何幸福地生活下去。。老马因痛失儿子,对盗猎贼心怀仇恨,一度陷入了复仇的阴暗情绪之中,却逐渐被小谷的热诚和善良打动,最终重拾了希望。而盗猎贼则与老马截然相反,为一己私欲夺取无辜的生命,并为了复仇而一意孤行,最终以悲惨的结局收场。。