《闪亮的爸爸第二季》较之第一季更突显的现实教育意义,也成为“闪爸”们即将面临的另一个挑战。本季节目选择留守儿童参与节目录制,旨在通过明星与孩子的相处引导社会正视亲子关系,了解“爱与陪伴”才是教育的本质所在,从而向更多受众传递社会正能量。。1942年的韩国首尔,那时还叫做京城,正处在日本殖民统治之下。从日本留学归来的夫妻档金东原(金泰宇 饰)和金仁英(金宝京 饰),受上级的委托,被任命进入京城的安生病院工作。从外表上看,这是座颇具欧洲风情的漂亮建筑,但内里,却总是怪事不断。医院里聚集了从各处来的人。其中,有即将和医院院长的女儿结婚的前美术生振南(陈久 饰);有性格阴郁但医术高超的医师李秀仁(李东奎 饰)等。他们在医院中,邂逅了各式各样的人。振南对自杀的女高中生尸体产生了难解的心情;秀仁邂逅了失语症少女(高珠妍 饰);而东原在这时发现了妻子似乎藏着什么秘密。
医院外的世界战火纷纷,而医院内的形式也是扑朔迷离。这到底只是奇谈,还是确有其事?。宰辅严嵩(刘永)权倾朝野,势力庞大,以权谋私,引发出连串冤案,清官海瑞(陈威庭)目睹严氏一党败坏朝纲,官场黑暗腐败,为官者贪污舞弊,陷害忠良,遂立志铲除奸党,与恶势力周旋到底,最后,瑞冒死挥书向皇上十奏嵩之罪状,嵩百词莫辩,下狱而去,瑞为君为民除一大恶,成千古颂歌,流芳百世.........。